Tras la fase de selección interna, las organizaciones políticas han presentado sus precandidaturas al Consejo Nacional Electoral (CNE) para ser evaluadas y calificadas. De un total de 584 listas proclamadas en los procesos de democracia interna, solo 543 fueron inscritas oficialmente, lo que dejó fuera del proceso a 41 listas. Estas candidaturas corresponden a diferentes cargos, como binomios presidenciales, asambleístas nacionales, provinciales, del exterior y parlamentarios andinos.
Una de las razones principales por las que algunas listas no fueron admitidas es la falta de cumplimiento con el requisito de paridad de género. Algunas organizaciones no lograron que el 50% de sus listas estuviera encabezada por mujeres, como exige la ley electoral. Además, la obligatoriedad de inscribir primero a las candidatas femeninas generó descontento en algunos partidos. En cuanto a los cargos de asambleístas por el exterior, ocho agrupaciones no presentaron candidatos, mientras que en el caso de los asambleístas provinciales faltaron 32 listas por inscribir.
El CNE, al revisar las candidaturas, se enfoca en que cumplan los requisitos establecidos en el Código de la Democracia. Para binomios presidenciales, se exige que los candidatos sean ecuatorianos de nacimiento, tengan 35 años cumplidos al momento de la inscripción y estén en pleno uso de sus derechos políticos. Los aspirantes a asambleístas y representantes al Parlamento Andino deben tener al menos 18 años, estar inscritos en el registro electoral de la jurisdicción que buscan representar y haber votado en las elecciones anteriores.
El CNE no verifica de manera automática todas las posibles inhabilidades de los candidatos, como deudas con el IESS, pensiones alimenticias impagas o condenas judiciales, pero las listas pueden ser objetadas si algún partido, alianza o elector demuestra la afectación de un derecho. Una vez inscritas las listas, se notifica a las organizaciones políticas, quienes tienen 48 horas para presentar objeciones. El Tribunal Contencioso Electoral cuenta con 72 horas para revisar posibles recursos, y solo después de ese proceso se considerarán firmes las candidaturas, en un plazo que podría culminar a finales de diciembre.