La jueza Marty Fulgueira autorizó que José Serrano presente nuevamente un habeas corpus, recurso con el que busca recuperar su libertad en Estados Unidos. Aunque en octubre de 2025 la propia jueza Fulgueira determinó que no tenía competencia para tratar el caso, este 1 de junio de 2016 dejó sin efecto el informe y las recomendaciones relacionadas con la primera solicitud de habeas corpus.
En el proceso figuran como demandados Juan López-Vega, director en funciones de la Oficina Local de Miami, Operaciones de Control y Expulsión, del Servicio de Inmigración y Control de Aduanas de los Estados Unidos; Todd Lyons, director en funciones del Servicio de Inmigración y Control de Aduanas de los Estados Unidos; y Charles Parra, subdirector de campo a cargo del Centro de Tramitación de Servicios de Krome North.
José Serrano permanece detenido por razones migratorias en el centro de detención de Krome desde agosto de 2025. Desde entonces, el exministro ha realizado varios intentos para obtener su liberación y frenar su deportación a Ecuador. Respecto a este último objetivo, consiguió una medida temporal en mayo de este mayo, cuando la justicia le otorgó protección bajo la Convención Contra la Tortura (CAT).
Finalmente, José Serrano enfrenta en Ecuador un proceso como presunto autor intelectual del asesinato de Fernando Villavicencio y tiene una orden de prisión preventiva pendiente. Por ello, si su deportación se concreta, será trasladado directamente a una cárcel al llegar al país.